О проекте
Новый проект "Медицинская химия" – статьи про медицинскую химию, разработку лекарств и применение в ней компьютерных технологий, фармакологию, сопровождающиеся красочными иллюстрациями и видео. В подготовке материала используются различные источники. Проект в стадии активной разработки:) В целях популяризации науки…
Постеры
Материалы раздела «Медицинская химия» – статьи, модели молекул, тезисы…

CDK4 — циклинзависимая киназа 4
Модели молекул циклинзависимой киназы 4 (CDK4) — картинки и анимации.
Циклинзависимая киназа 4 — регулируемый циклином белок, играющий ключевую роль в регуляции клеточного цикла. Важная терапевтическая мишень.

Ацетилхолинэстераза
Модели молекул ацетилхолинэстеразы и её ингибитора донепезила — картинки и анимации.
…Для передачи нового сигнала необходимо удалить «отработавший» ацетилхолин из синаптической щели. Ацетилхолинэстераза катализирует гидролиз ацетилхолина до холина и уксусной кислоты…

Молекулярное моделирование
Различные изображения, анимации и видео на тему молекулярного моделирования и разработки лекарств: симуляция взаимодействия лекарства с терапевтической мишенью, модели молекул лекарственных препаратов и рецепторов.

Докинг
Статья носит популяризационный характер и отражает мое (возможно не совсем корректное) понимание докинга на основе прочитанной литературы и пользования прикладными программами. Когда это самое "понимание" изменится, я обязательно напишу еще одну статью :)
Описаны основные принципы молекулярного докинга, алгоритмы и процесс докинга, виртуальный скрининг…
Свойства ведущих соединений
Рассмотрены такие свойства ведущих соединений (лидеров), как биологическая доступность, растворимость, структура, устойчивость. Статья сопроваждается 2D и 3D моделями молекул лекарств (картинки и анимации) и видео взаимодействия лекарства с мишенью.

Участки связывания рацетамов с AMPA-рецепторами
Общая характеристика рацетамов, новые участки связывания пирацетама и анирацетама с AMPA-рецепторами. 3D модели молекул пирацетама, анирацетама, ГАМК, изображения участков связывания, видео докинга.

Тезисы Molecular Modeling – A Modern Approach to Drug Discovery
Тезисы к докладу на конференции по химии на английском языке. Молекулярное моделирование – современный подход к разработке лекарств. Принципы молекулярного моделирования. Разработка лекарств. Применение молекулярного моделирования.
Rational drug discovery is one of the most actual issues of medicinal chemistry. Application of molecular modelling techniques can bring discovery of drugs to new level with minimal costs…

Тезисы Изучение взаимодействия производных фаскаплизина с активным сайтом ацетилхолинэстеразы методом молекулярного моделирования
В данной работе был проведен молекулярный докинг серии производных фаскаплизина с активным сайтом ацетилхолинэстеразы с целью изучения влияния введенных фрагментов на взаимодействие с участком связывания и выявления среди них наиболее перспективных соединений для последующего получения и изучения.

Тезисы MOLECULAR DOCKING STUDY OF FASCAPLYSIN DERIVATIVES INTERACTION WITH CDK4
Fascaplysin is a red pigment that was isolated in 1988 from marine sponge Fascaplysinopsis sp. This alkaloid exhibits antifungal, antibacterial, antiviral properties and anticancer activity against a wide range of tumor cells. Fascaplysin is a highly selective inhibitor of cyclin-dependent kinase 4 (CDK4) which plays a key role in cell cycle regulation and is an important target for anticancer drugs.

Тезисы FASCAPLYSIN DERIVATIVES AS μ-OPIOID RECEPTOR AGONISTS: MOLECULAR MODELING STUDY
Fascaplysin is a sponge-derived red pigment that exhibits a wide range of biological activity among which are antibacterial, antifungal, antiviral and anticancer properties. Recently it was reported that fascaplysin serves as selective μ–opioid receptor (MOR) agonist with a signaling profile that resembles endorphins. It makes fascaplysin a perspective compound for development of novel analgesics with reduced side effects.
- Protein Data Bank – трехмерные структуры макромолекул
- Chemspider – 2D и 3D структуры химических соединений
- Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза МГУ
- UCSF Chimera—a visualization system for exploratory research and analysis. Pettersen EF, Goddard TD, Huang CC, Couch GS, Greenblatt DM, Meng EC, Ferrin TE. J Comput Chem. 2004 Oct;25(13):1605-12.
- O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461
- Morris, G. M., Huey, R., Lindstrom, W., Sanner, M. F., Belew, R. K., Goodsell, D. S. and Olson, A. J. (2009) Autodock4 and AutoDockTools4: automated docking with selective receptor flexiblity. J. Computational Chemistry 2009, 16: 2785-91.
- Thomas G. Medicinal Chemistry. Chichester: John Wiley; 2007.
- Nadendla R. Principals Of Organic Medicinal Chemistry. New Delhi: New Age International; 2005.
- Patrick G. An Introduction To Medicinal Chemistry. Oxford: Oxford University Press; 2005.